Přestože počet případů pozitivity SARS-CoV-2 v uplynulém týdnu výrazně poklesl, Oddělení klinické mikrobiologie a imunologie zachytilo první případ varianty omikron a to u jednoho ze zaměstnanců Fakultní nemocnice Brno, kterému byl proveden stěr na základě mírných příznaků. Do dvou dnů byly vyšetřeny i kontakty zaměstnance, omikron byl potvrzen u dvou rodinných příslušníků a jednoho dalšího zaměstnance nemocnice.

Že projdou rukama laborantů brzy i další případy nákazy variantou omikron bylo jasné, viry jsou velmi proměnlivé patogeny a přirozeně mutují, je vždy jen otázka času, kdy nová varianta koronaviru převládne. Další pozitivní vzorky vykazující definované prvky varianty omikron zachytila laboratoř ve středu 8. prosince u dvou školáků z Adamova. Tyto případy nemají s výskytem v Brně pravděpodobně žádnou souvislost. K těmto dvěma v sobotu 11. prosince přibyl další, stěr je opět od jednoho z místních dětí. Všechny případy byly odhaleny z rutinního testování pomocí metody diskriminační PCR, která byla následně doplněna o celogenomovou sekvenaci. U podezřelých případů byla potvrzena varianta omikron BA.1. Nakažení mají lehký nebo bezpříznakový průběh onemocnění. Nikdo z infikovaných variantou omikron neměl cestovatelskou anamnézu či kontakt s někým, kdo nedávno přicestoval do ČR. Lze tedy hovořit o komunitním šíření. O výskytu nových variant, včetně mutace omikron, je rychle informována Krajská hygienická stanice, tak, aby mohla zajistit předností trasování případných kontaktů.

Asi třetina laboratoří v republice včetně té ve Fakultní nemocnice Brno je schopná odhalit nové varianty SARS-CoV-2 již při základním testování. Takové laboratoře tedy odhalí nastupující varianty s vyšší pravděpodobností. Reálný výskyt mutace lze však předpokládat i v ostatních oblastech republiky. Nyní Oddělení klinické mikrobiologie a imunologie pomáhá s testováním a diskriminační PCR vzorků z části kraje Vysočina a z několika nemocnic z Jihomoravského kraje.

Zdroj a foto: FN Brno